新冠肺炎愈演愈烈至今已两月有余,学者们对病毒源头的追溯到也未曾间断。研究结果现代科学华南海鲜市场被“事”2 月 20 日,中国科学院西双版纳热带植物园通过官网公布研究成果信息称之为,武汉华南海鲜市场的新型冠状病毒就是指其他地方起源于的 ,假设此市场不是病毒发源地。
而人际传播在有可能 2019 年 12 月,甚至 11月下旬之后开始了。研究人员搜集了累计 2 月 12 日全世界分享到 GISAID EpiFluTM 数据库的病毒数据,还包括四大洲 12 个国家的 93 个新冠病毒样本。
其中,来自湖北武汉的样本的采样累计日期为 1 月 5 日,全球样本的最晚采样日期是 2 月 3 日。结论一:华南海鲜市场的新型冠状病毒就是指其他地方起源于的通过仅有基因组数据解析,研究者找到搜集到的 93 个样本包括 58种单倍型(基因类型 haplotypes,即若干个要求同一性状的紧密连锁的基因包含的基因型),以超级传播者单倍型为中心,研究者将其概括为 5两组,它们联合包含一个病毒演化网络。
5 个中心分别为 3 个古老超级传播者单倍型 H1 、H3 和 H13 ,以及 2 个新的超级传播者单倍型 H56 、mv2。其中,H1 单倍型最多,其派生单倍型也最多。
单倍型进化网络表明,所有单倍型中,单倍型 H13 和 H38 有可能是古老/祖先单倍型,它们有可能通过一个中间单倍型与蝙蝠冠状病毒 RaTG13 相关联,由于目前的样品中没第一例感染者的样本和 12 月初的早期感染者的样本,最初的古老/祖先单倍型有可能还没被找到。而与华南海鲜市场有关联的患者样品的单倍型都是 H1 及其派生的单倍型 H2 及 H8-H12 ,这指出市场在短期内不存在传播病毒感染。
此外,有一份武汉样品单倍型 H3 与华南海鲜市场牵涉到,研究人员指出,H1 及其派生的单倍型有可能源于 H3 ,华南海鲜市场不不存在新冠病毒完整来源,新冠病毒有可能就是指其它地方输出。此前的研究也表明,首先确认的不受病毒感染患者与市场没联系,因而研究者指出有可能是感染者将病毒传播给市场上的工人或卖方,然后很快在市场上流通,挤迫的市场增进了病毒更进一步传播给买家,并于 2019 年 12 月上旬传播出去。这个研究也印证了此前 1 月 24 日公开发表在《柳叶刀》的研究结论,即跟踪第一批 41 个发病病例找到,这批最先在 12 月 1 日报告的病例中,总共有 13 个病例与海鲜市场无认识史。
也就是说,病毒在转入海鲜市场之前就早已藏身武汉居民的生活中,但华南海鲜市场依旧是病毒蔓延的“中介”之一。结论二:新型冠状病毒或在 12 月初和 1 月 6 日左右再次发生过 2 次显著的种群扩展此外,根据新型冠状病毒基因组数据推算出 1 月之前的种群扩展再次发生时间是 12 月 8 日,该结果似乎病毒有可能在 12 月初,甚至 11 月下旬即早已开始有人际传播,随后在华南海鲜市场减缓了人际传播。研究推算出 2 月份之前的种群扩展时间在 1 月 6 日,这个有可能与元旦假期有关联。
必须认为,这一天国家疾控中心公布了 2级应急号召。当时的预警起着了一些警告起到,公众活动和上下班都有所增加。
如果当时的警告能引发大众更加普遍的推崇,那么1月份中下旬向全国和全球蔓延到的病例不会有所减少。研究人员更进一步证实我国其他 9个省区和其他 11 个国家的病毒感染病例基本都就是指武汉必要或者间接输出而来。结论三:现蔓延的病例最少来自于 3 个途径另外,为了需要细分来源,研究人员将 58 种单倍型分为了五组,使用标准是 3 个中心(古老超级传播者)单倍型(H1, H3 和 H13 )和 2个 新的超级传播者单倍型( H56 和 mv 2)。以此辨别出有广东的病毒有可能有三个来源,重庆和台湾的病毒有两个来源。
其中,广东深圳一家人在早期就通过人传人展开了传播。有较多样本的澳大利亚、法国、日本和美国,他们的患者感染源最少有两个,特别是在是美国还包括了五个来源。
十分有一点注目的是 H56 这个超级传播者单倍型,它同时是澳大利亚、法国和美国,以及我国台湾患者的传染源。其他国家患者因为样品较为较少,大多数的来源较为单一,他们除了是武汉旅游输出或在武汉病毒感染外,有一些人有可能是在广东、新加坡等地被病毒感染。结论四,新冠病毒基因组仍未再次发生重组事件好消息是,研究人员找到新冠病毒基因组没再次发生显著的重组事件。
他们在 8 个蛋白质编码区找到了120 个核苷酸变异点位,基因组中的 10 个蛋白质编码区的变异点位均匀分布。120 个变异的核苷酸关联了 119 个氨基酸密码子,其中 79 个密码子 ( 65.83% )转变了氨基酸类型,并有 42 个( 53.17% )氨基酸化学系性质都被转变。目前研究者尚能不确切这些氨基酸类型以及化学系性质转变否不会影响新冠病毒的活性,必须其他蛋白组学和结构生物学方面的专业人士展开检验。
美国或将是病毒源头?诚然,确认海鲜市场是不是病毒发源地对于找寻病毒的来源,以及确认中间宿主,对疫情的掌控和防止再度愈演愈烈具备至关重要的意义,但不吃瓜群众们对病毒源头到底是谁更加扑朔迷离。日本朝日电视台昨日傍晚报导,声称“ CDC 美国疾病管理防治中心公布难以置信的消息,猜测一万多的流感丧生人数中,有一部分是杀于新冠肺炎的,检查体制有漏洞,早已开始新的检测方式,并敦促有新的冠症状的患者新的检查……”网友们之后开始猜测:怎么会幕后的黑手是美军?但问题是,即便幕后黑手是美国,美国为什么要这么做到呢?按照网友们的猜测,美国来中国参与军运会时,美国正在愈演愈烈流感,最后一批最晚 11月 15日离开了, 12月底武汉就找到了受病毒感染的新冠病毒患者,时间不堪称不凑巧......但这或许也不是我们应当猜测美国的理由,却是,在真凶出来之前,谁都无法妄下定论。
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